{"id":1045,"date":"2014-07-14T10:16:38","date_gmt":"2014-07-14T13:16:38","guid":{"rendered":"http:\/\/blog.scielo.org\/es\/?p=1045"},"modified":"2019-05-02T14:50:38","modified_gmt":"2019-05-02T17:50:38","slug":"el-movimiento-open-data-se-consolida-internacionalmente","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blog.scielo.org\/es\/2014\/07\/14\/el-movimiento-open-data-se-consolida-internacionalmente\/","title":{"rendered":"El Movimiento Open Data se consolida internacionalmente"},"content":{"rendered":"
\"\"<\/a>

Fuente de la imagen: JulieBeck<\/a>.<\/p><\/div>\n

Como se anunci\u00f3 en este blog1<\/sup>, el primer n\u00famero de la revista en acceso abierto Scientific Data<\/em>2 <\/sup><\/em>acaba de ser publicada el d\u00eda 24 de junio por el Nature Publishing Group<\/em>, el grupo editorial responsable por la prestigiosa colecci\u00f3n Nature<\/em>. La nueva publicaci\u00f3n es un espacio para la publicaci\u00f3n formal de descripciones de conjuntos de datos (datasets<\/em>), denominados Data Descriptors\u00b3.<\/em><\/p>\n

La revista es revisada por pares y publicada solamente en la versi\u00f3n electr\u00f3nica. Los autores pagan una tasa de publicaci\u00f3n (a partir de US$ 900, de acuerdo con el tipo de licencia o pa\u00eds de afiliaci\u00f3n), lo que asegura su inmediata disponibilidad en Acceso Abierto, con su contenido bajo licencia Creative Commons Attribution<\/em> (CC-BY) y cuyos metadatos de los datasets<\/em> quedan disponibles en formato legible por computadores (machine readable<\/em>).<\/p>\n

El lanzamiento de la revista es el producto de la creciente concientizaci\u00f3n por parte de la academia, instituciones de investigaci\u00f3n, agencias de desarrollo, sector privado, gobiernos y la sociedad civil de la importancia en hacer disponibles los datos experimentales provenientes de la investigaci\u00f3n cient\u00edfica y proporcionar la interoperabilidad de \u00e9stos con los art\u00edculos que los originaron. La capacidad de la ciencia en progresar a partir de los estudios realizados, y de la auto-correcci\u00f3n continua, encuentra uno de sus pilares en la disposici\u00f3n abierta de los datos.<\/p>\n

El mundo asisti\u00f3 hace pocas d\u00e9cadas a un cambio de paradigma en la comunicaci\u00f3n cient\u00edfica a trav\u00e9s de Internet y las tecnolog\u00edas digitales con la publicaci\u00f3n digital en l\u00ednea de revistas y de nuevas formas de diseminaci\u00f3n, evaluaci\u00f3n, y comunicaci\u00f3n entre autores, editores, revisores y lectores. Una consecuencia natural de este proceso \u2013 y posiblemente un nuevo paradigma \u2013 considera que los datos que fueron usados para generar un art\u00edculo cient\u00edfico deben estar disponibles en repositorios de acceso abierto, de la misma forma que un n\u00famero cada vez mayor de art\u00edculos se hacen disponibles en acceso abierto, transcurrido el per\u00edodo de embargo impuestos por los editores (v\u00eda verde), si no es del caso que sean inmediatos, en el caso de la v\u00eda dorada.<\/p>\n

Seg\u00fan el editorial del primer n\u00famero (2014) de Scientific Data<\/em>, \u201cla cuesti\u00f3n no es si los datos de la investigaci\u00f3n deban ser compartidos, sino c\u00f3mo hacer que ese hecho de compartir sea efectivamente una parte com\u00fan y digna de reconocimiento de la cultura de la investigaci\u00f3n\u201d (traducci\u00f3n libre). Con la nueva revista se abre un espacio a los investigadores para que describan formalmente un conjunto de datos originales (datasets<\/em>) y las t\u00e9cnicas usadas para obtenerlos, y referenciar a los lectores a art\u00edculos que ya han incorporado esos datos. Tambi\u00e9n permite dar el cr\u00e9dito debido a los investigadores responsables por la producci\u00f3n de datos que los califican como autores en una publicaci\u00f3n tradicional.<\/p>\n

Con este nuevo cambio de paradigma \u2013 el intercambio de datasets<\/em>, que sean debidamente arbitrados y citables \u2013 se espera que la comunidad cient\u00edfica responda a fin de reconocer y dar cr\u00e9dito a los autores de estos datos, de la misma manera que hoy ocurre con la publicaci\u00f3n en revistas sometidas a la revisi\u00f3n por pares.<\/p>\n

Compartir datasets<\/em> encuentra particular relevancia en las ciencias que estudian el cambio clim\u00e1tico y la salud, en la opini\u00f3n del editor en jefe de Nature<\/em>, Philip Campbell. Campbell visit\u00f3 Brasil en marzo de 2014, cuando particip\u00f3 en la conferencia “Science as an open enterprise: open data for open Science<\/em>“4<\/sup> realizada en la sede de FAPESP, en San Pablo. En la ocasi\u00f3n, el editor de Nature destac\u00f3 la necesidad de considerar los costos y las consecuencias de la gesti\u00f3n de grandes cantidades de datos, y cit\u00f3 el informe5<\/sup> de la Royal Society<\/em> que tiene el t\u00edtulo de la conferencia, publicada en 2012 – un compendio escrito por expertos del Reino Unido analiza el impacto de las nuevas tecnolog\u00edas que dominan la comunicaci\u00f3n cient\u00edfica y orienta sobre c\u00f3mo los investigadores se deben adaptar a los cambios que se avecinan. El informe hace una serie de recomendaciones sobre c\u00f3mo almacenar, entregar, compartir e interoperar los datos de investigaci\u00f3n para una mejor utilizaci\u00f3n y reutilizaci\u00f3n.<\/p>\n

Adem\u00e1s del inter\u00e9s en los datasets<\/em>, por las razones expuestas, es necesario considerar que esta pr\u00e1ctica deber\u00e1 aumentar la reproducibilidad de los resultados de la investigaci\u00f3n. Cuanto m\u00e1s investigadores hagan disponibles abiertamente sus datos en repositorios de acceso abierto, ser\u00e1 mayor la probabilidad de que otros puedan replicar su trabajo, con beneficios evidentes para todos. Como ya se ha comentado en este blog6<\/sup>, la falta de reproducibilidad en los resultados de la investigaci\u00f3n es un tema que preocupa no solamente a la comunidad cient\u00edfica, sino al sector privado, los gobiernos y a la sociedad.<\/p>\n

Una raz\u00f3n particularmente importante por la cual es importante adoptar pol\u00edticas de almacenamiento y la puesta en com\u00fan de los datasets <\/em>est\u00e1 ligada a la preservaci\u00f3n digital de \u00e9stos en forma permanente. Una investigaci\u00f3n realizada por investigadores de Canad\u00e17<\/sup> evalu\u00f3 el mantenimiento de datos por los autores de los art\u00edculos que les dieron origen, publicados entre dos y 22 a\u00f1os atr\u00e1s. Los resultados indican que la p\u00e9rdida de datos es mayor cuanto m\u00e1s antigua es la publicaci\u00f3n. La probabilidad de que los datos de un art\u00edculo hayan sido conservados por el autor caen por un factor de 17% al a\u00f1o. A esto se suma la dificultad de localizar a los autores, ya que las publicaciones m\u00e1s antiguas no incluyen direcciones electr\u00f3nicas o est\u00e1n desactualizadas. La probabilidad de ponerse en contacto con un autor cae a raz\u00f3n de 7% al a\u00f1o. De esta forma, se estima que el 80% de los datos no estar\u00e1n disponibles despu\u00e9s de 20 a\u00f1os de su generaci\u00f3n.<\/p>\n

Las agencias de financiaci\u00f3n son socios importantes que est\u00e1n apoyando \u2013 y financiando iniciativas como repositorios para el almacenamiento, recuperaci\u00f3n y compartir los datos. La National Science Foundation<\/em> de Estados Unidos, por ejemplo, implement\u00f3 una pol\u00edtica detallada sobre el dep\u00f3sito de datos de investigaci\u00f3n para investigaciones financiadas por la instituci\u00f3n8<\/sup>.<\/p>\n

Las agencias federales de financiaci\u00f3n del Canad\u00e1 est\u00e1n desarrollando una iniciativa conjunta para mejorar el acceso a la investigaci\u00f3n financiada con recursos p\u00fablicos \u2013 y los datos relativos a las mismas \u2013 de acuerdo con normas y est\u00e1ndares internacionales. Los t\u00e9rminos del Tri-Council Open Access Policy<\/em> est\u00e1n disponibles en la p\u00e1gina de la Universidad de Waterloo9<\/sup>.<\/p>\n

Los datasets<\/em>, como hemos dicho, son contenidos arbitrados, constituyendo una fuente de referencia por la cual los autores reciben el cr\u00e9dito, tal como sucede con las publicaciones tradicionales en las revistas. Adem\u00e1s, se proporcionar\u00e1 DOI (digital object identifier<\/em>), pudiendo ser citados. En este sentido, se espera que las citas del art\u00edculo aumenten mediante hacer disponibles sus datos en forma abierta.<\/p>\n

En vista de esta amplia fuente de citas, la mayor y m\u00e1s prestigiosa base internacional de revistas cient\u00edficas del mundo \u2013 el Web of Science<\/em> (Thomson Reuters) cre\u00f3 el Data Citation Index<\/em>, complementando los ya existentes Science Citation Index<\/em>, Social Science Citation Index<\/em> y el SciELO Citation Index<\/em>, que comenz\u00f3 a operar en el inicio de 2014.<\/p>\n

El Data Citation Index10<\/sup>, <\/em>inaugurado a principios de 2013, permitir\u00e1 a los investigadores acceder en una sola base de datos a numerosos repositorios de datasets<\/em>, exponiendo el impacto de la investigaci\u00f3n adem\u00e1s de los contenidos publicados. Mediante la estandarizaci\u00f3n de la pr\u00e1ctica de citas a datos, los investigadores tendr\u00e1n m\u00e1s oportunidad en ganar reconocimiento por su trabajo. De la misma forma, las instituciones de financiaci\u00f3n ganar\u00e1n mayor visibilidad e impacto de la investigaci\u00f3n que financian permitiendo, inclusive, que los resultados obtenidos puedan ser usados por otros investigadores.<\/p>\n

Teniendo en cuenta el avance el movimiento opendata<\/em>, muchos editores ya avanzaron en la elaboraci\u00f3n de pol\u00edticas y metodolog\u00edas para el almacenamiento y recuperaci\u00f3n de datos. A continuaci\u00f3n veremos algunos ejemplos:<\/p>\n

PLoS<\/h3>\n

Como una de las iniciativas pioneras m\u00e1s importantes en la publicaci\u00f3n en acceso abierto, la Public Library of Science<\/em> \u2013 PloS public\u00f3 en diciembre de 2013 la Data Access for the Open Access Literature: PLOS\u2019s Data Policy<\/em>11<\/sup> (Pol\u00edtica de Acceso a Datos para la Literatura en Acceso Abierto), en vigor desde el 1\u00ba de marzo de 2014.<\/p>\n

El editor jefe de PloS Biology<\/em>, Theo Blom, explica que en consonancia con la pol\u00edtica de acceso abierto de la colecci\u00f3n, los datos b\u00e1sicos deben ser de libre acceso a los investigadores para la replicaci\u00f3n, revisi\u00f3n, interpretaci\u00f3n, o inclusi\u00f3n en metan\u00e1lisis, de forma de facilitar la reproducibilidad de la investigaci\u00f3n y el progreso cient\u00edfico. Las revistas PloS solicitaron la disponibilidad de los datos desde su inicio, pero reci\u00e9n en 2013 fue elaborado un conjunto de metodolog\u00edas y pol\u00edticas para el almacenamiento.<\/p>\n

De acuerdo con esta pol\u00edtica, para presentar un manuscrito en l\u00ednea, los autores deben proporcionar una Declaraci\u00f3n de Disponibilidad de Datos (Data Availability Statement)<\/em> que se publicar\u00e1 despu\u00e9s de la aprobaci\u00f3n del manuscrito. La negativa a compartir los datos y metadatos relacionados proporciona una raz\u00f3n para el rechazo del art\u00edculo. PloS recomienda el dep\u00f3sito de los datos en repositorios p\u00fablicos como Dryad Dygital Repository<\/em>. Las secuencias g\u00e9nicas, estructuras de prote\u00ednas, ensayos cl\u00ednicos y modelos biol\u00f3gicos pueden ser depositados en bases espec\u00edficas, como GenBank, Protein Data Bank, y Clinical Trials.gov, respectivamente, y define adem\u00e1s como minimal dataset<\/em> al conjunto de datos utilizados para llegar a las conclusiones que constan en el manuscrito y que deben estar disponibles debidamente.<\/p>\n

Taylor and Francis<\/h3>\n

Este editor todav\u00eda no defini\u00f3 pol\u00edticas para compartir datasets<\/em> procedentes de los art\u00edculos publicados en sus revistas (algunos de acceso abierto v\u00eda dorada, otros h\u00edbridos), sin embargo especifica en su portal12<\/sup>, que los autores que usan datasets<\/em> de otros en sus art\u00edculos deben indicar c\u00f3mo fueron seleccionados estos datos e informar la URL de la fuente de los datos para permitir que sus resultados sean pasibles de reproducci\u00f3n por otros autores.<\/p>\n

Springer<\/h3>\n

El editor informa en su portal13<\/sup> que la presentaci\u00f3n de un manuscrito a una revista de acceso abierto de la colecci\u00f3n (Springer Open) implica que los materiales reproducibles descritos en el manuscrito, incluyendo datos b\u00e1sicos relevantes, deben estar a disposici\u00f3n para cualquier investigador que los quiera usar para fines no comerciales. El editor no dispone de un repositorio o pol\u00edticas espec\u00edficas para este procedimiento, pero informa que repositorios con esta finalidad est\u00e1n ampliamente disponibles tales como bancos de datos para secuencias de \u00e1cidos nucleicos y prote\u00ednas, y repositorios de agencias de financiaci\u00f3n. Una lista completa de estos est\u00e1 disponible14<\/sup>.<\/p>\n

SciELO<\/h3>\n

El Programa SciELO ha seguido de cerca la tendencia mundial referente a compartir datos de investigaci\u00f3n. En la Conferencia SciELO 15 A\u00f1os, la preservaci\u00f3n y compartir datos fue el tema de la conferencia dada por Todd Vision15<\/sup>, bi\u00f3logo e investigador de la University of North Carolina at Chapel Hill<\/em> y co-fundador de Dryad Digital Repository, iniciativa que se ocupa de la preservaci\u00f3n y disponibilidad en acceso abierto de datasets<\/em> provenientes de la literatura cient\u00edfica y m\u00e9dica, en colaboraci\u00f3n con revistas, sociedades cient\u00edficas y editores.<\/p>\n

SciELO pretende, a partir de 2015, dar inicio a la pol\u00edtica de solicitar a los autores que publican en las revistas de la colecci\u00f3n la disponibilidad de los datos de la investigaci\u00f3n en repositorios. El Programa est\u00e1 colaborando con la iniciativa DataFAIRport \u2013 F<\/em><\/strong>ind, A<\/strong>ccess, I<\/strong>nteroperatele & R<\/strong>e-use<\/em>. La iniciativa FAIRport, fundada en enero de 2013, tiene por objetivo mejorar los datos de la investigaci\u00f3n que est\u00e1 siendo desarrollada por una red de especialistas e instituciones.<\/p>\n

Por lo tanto, uno de los programas m\u00e1s importantes de publicaci\u00f3n de revistas en acceso abierto del hemisferio sur \u2013 y del mundo \u2013 una vez m\u00e1s se destaca por adoptar el estado del arte en pol\u00edticas y metodolog\u00edas a favor del acceso abierto bajo todos los aspectos.<\/p>\n

Notas<\/h3>\n

\u00b9Scientific Data: Nature Publishing Group avanza la comunicaci\u00f3n de datos cient\u00edficos con nueva publicaci\u00f3n online en acceso abierto<\/em>. SciELO en Perspectiva. [viewed 01 June 2014]. Available from: http:\/\/blog.scielo.org\/es\/2014\/02\/04\/scientific-data-nature-publishing-group-avanza-la-comunicacion-de-datos-cientificos-con-nueva-publicacion-online-en-acceso-abierto\/<\/a><\/p>\n

\u00b2 YU, Y., et al. Comprehensive RNA-Seq transcriptomic profiling across 11 organs, 4 ages, and 2 sexes of Fischer 344 rats. <\/em>Scientific Data. 2014. Available from: http:\/\/www.nature.com\/articles\/sdata201413<\/a><\/p>\n

\u00b3Data Descriptors – <\/em>http:\/\/www.nature.com\/sdata\/<\/a><\/p>\n

\u2074 CAMPBELL, P. Conferencia Science as an Open Enterprise: open data for open Science. 2013. Available from: http:\/\/www.fapesp.br\/eventos\/scienceOpenEnterprise<\/a><\/p>\n

\u2075 Science as an open enterprise. The Royal Society Science Policy Centre report. 2012, n. 02. Available from: http:\/\/royalsociety.org\/uploadedFiles\/Royal_Society_Content\/policy\/projects\/sape\/2012-06-20-SAOE.pdf<\/a><\/p>\n

6<\/sup>La reproducibilidad en los resultados de investigaci\u00f3n: la punta del iceberg<\/em>. SciELO en Perspectiva. [viewed 01 June 2014]. Available from: http:\/\/blog.scielo.org\/es\/2014\/02\/27\/la-reproducibilidad-en-los-resultados-de-investigacion-la-punta-del-iceberg\/<\/a><\/p>\n

7<\/sup> Vines, T. H., et al.<\/em> The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age<\/em>. Curr. Biol. 2014, vol. 24, n. 1. Available from: http:\/\/www.cell.com\/current-biology\/abstract\/S0960-9822%2813%2901400-0<\/a><\/p>\n

8<\/sup> Dissemination and Sharing of Research Results. NSF Data Sharing Policy<\/em>. Available from: http:\/\/www.nsf.gov\/bfa\/dias\/policy\/dmp.jsp<\/a><\/p>\n

9<\/sup> Open data Guide<\/em>. University of Waterloo. Available from: http:\/\/subjectguides.uwaterloo.ca\/content.php?pid=333963&sid=3122909<\/a><\/p>\n

10<\/sup> Citation Index – http:\/\/wokinfo.com\/\/products_tools\/multidisciplinary\/dci\/<\/a><\/p>\n

11<\/sup> Data Access for the Open Access Literature: PLOS\u2019s Data Policy<\/em>. Plos. Available from: http:\/\/www.plos.org\/data-access-for-the-open-access-literature-ploss-data-policy\/<\/a><\/p>\n

12<\/sup> Datasets<\/em>. Taylor & Francis Author Services. Available from: http:\/\/journalauthors.tandf.co.uk\/preparation\/writing.asp#link21<\/a><\/p>\n

13<\/sup> Availability of supporting data<\/em>. Springer One. Available from: http:\/\/www.springeropen.com\/about\/supportingdata<\/a><\/p>\n

14<\/sup> DataCite. Reposit\u00f3rios para dados de pesquisa – http:\/\/www.datacite.org\/repolist\/<\/a><\/p>\n

15<\/sup> Conferencia SciELO 15 anos – http:\/\/www.scielo15.org\/todd-vision\/<\/a><\/p>\n

V\u00eddeo da apresenta\u00e7\u00e3o (em ingl\u00eas) – https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=-4xshxMqZsU<\/a><\/p>\n

Referencia<\/h3>\n

More bang for your byte<\/em>. Editorial. Scientific Data. 2014. Available from: http:\/\/www.nature.com\/articles\/sdata201410<\/a><\/p>\n

Enlaces externos<\/h3>\n

Dryad Digital Repositort – http:\/\/datadryad.org\/<\/a><\/p>\n

BioModels database – http:\/\/clinicaltrials.gov\/<\/a><\/p>\n

GenBank – http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/Genbank\/<\/a><\/p>\n

Protein Data Bank – http:\/\/www.rcsb.org\/pdb\/<\/a><\/p>\n

ClinicalTrials.gov – http:\/\/clinicaltrials.gov\/<\/a><\/p>\n

Data FAIRport initiative \u2013 http:\/\/www.datafairport.org\/<\/a><\/p>\n

DTL – http:\/\/www.dtls.nl\/<\/a><\/p>\n

ELIXIR – http:\/\/www.elixir-europe.org\/<\/a><\/p>\n

Force11 Data Citation Principles – https:\/\/www.force11.org\/datacitation<\/a><\/p>\n

Nature – Available from: http:\/\/www.nature.com\/<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

\"lilian\"<\/a>Sobre\u00a0Lilian Nassi-Cal\u00f2<\/h3>\n

Lilian Nassi-Cal\u00f2 estudi\u00f3 qu\u00edmica en el Instituto de Qu\u00edmica de la USP, tiene un doctorado en Bioqu\u00edmica por la misma instituci\u00f3n y un pos doctorado como becaria de la Fundaci\u00f3n Alexander von Humboldt en Wuerzburg, Alemania. Despu\u00e9s de concluir sus estudios, fue docente e investigadora en el IQ-USP. Trabaj\u00f3 en la industria privada como qu\u00edmica industrial y actualmente es Coordinadora de Comunicaci\u00f3n Cient\u00edfica en BIREME\/OPS\/OMS y colaboradora de SciELO.<\/p>\n

 <\/p>\n

Traducido del orginal en\u00a0portugu\u00e9s<\/a>\u00a0por Ernesto Spinak.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

El movimiento Open Data<\/i> \u2013 la presentaci\u00f3n de datos de investigaci\u00f3n cient\u00edfica para preservaci\u00f3n, consulta, uso y citaci\u00f3n \u2013 est\u00e1 ganando adeptos en todos los sectores de la academia, editores, revistas, instituciones de investigaci\u00f3n, y agencias de fomento. La iniciativa permitir\u00e1 una mayor interoperabilidad, transparencia, visibilidad e impacto de la investigaci\u00f3n, adem\u00e1s de asegurar la preservaci\u00f3n digital de los datos originales, que de otra forma tienden a perderse o tornarse inaccesibles con el pasar del tiempo. …<\/span> Read More →<\/span><\/a><\/span><\/p>\n","protected":false},"author":22,"featured_media":1046,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"om_disable_all_campaigns":false,"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"categories":[3],"tags":[18,7,48,33],"class_list":["post-1045","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-analisis","tag-acceso-abierto","tag-comunicacion-cientifica","tag-datos-abiertos","tag-politica-de-apoyo-a-la-comunicacion"],"aioseo_notices":[],"aioseo_head":"\n\t\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t